Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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