Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam198bQ3UPI1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam198bQ3UPI1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam198bQ3UPI1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam198bQ3UPI1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam198bQ3UPI1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam198bQ3UPI1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms