Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mccc2Q3ULD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mccc2Q3ULD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms