Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnep1r1Q3UJ81 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnep1r1Q3UJ81 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnep1r1Q3UJ81 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnep1r1Q3UJ81 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnep1r1Q3UJ81 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms