Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Greb1Q3UHK3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms