Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef3Q3UGY8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef3Q3UGY8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms