Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc58Q3UGP9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms