Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms