Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rnf166Q3U9F6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf166Q3U9F6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf166Q3U9F6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms