Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U6N9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms