Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YrdcQ3U5F4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
YrdcQ3U5F4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms