Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VwceQ3U515 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VwceQ3U515 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms