Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vars2Q3U2A8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms