Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U1D9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms