Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tatdn3Q3U1C6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms