Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc174Q3U155 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms