Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palb2Q3U0P1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palb2Q3U0P1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palb2Q3U0P1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms