Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hace1Q3U0D9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms