Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbq1bQ3U0A6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbq1bQ3U0A6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hbq1bQ3U0A6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hbq1bQ3U0A6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hbq1bQ3U0A6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbq1bQ3U0A6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hbq1bQ3U0A6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Hbq1bQ3U0A6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Hbq1bQ3U0A6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbq1bQ3U0A6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbq1bQ3U0A6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Hbq1bQ3U0A6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hbq1bQ3U0A6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbq1bQ3U0A6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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