Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd6Q3TY92 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd6Q3TY92 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms