Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc28Q3TX51 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms