Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm2Q3TWN3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms