Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calr4Q3TQS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calr4Q3TQS0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Calr4Q3TQS0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms