Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CiartQ3TQ03 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms