Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms