Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fubp3Q3TIX6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fubp3Q3TIX6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms