Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms