Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms