Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam178bQ24JP3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam178bQ24JP3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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