Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm1123Q1RME4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms