Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap25Q1EHW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap25Q1EHW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms