Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klrb1Q0ZUP1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klrb1Q0ZUP1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms