Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim24Q0VG18 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim24Q0VG18 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms