Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2b3Q0VF55 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b3Q0VF55 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms