Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
StumQ0VBF8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms