Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Neurl1bQ0MW30 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms