Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc7a1Q09143 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc7a1Q09143 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc7a1Q09143 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc7a1Q09143 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc7a1Q09143 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc7a1Q09143 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms