Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cass4Q08EC4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms