Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms