Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms