Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CbfbQ08024 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms