Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrstQ06666 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrstQ06666 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrstQ06666 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms