Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprgQ05909 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprgQ05909 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprgQ05909 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprgQ05909 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprgQ05909 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprgQ05909 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprgQ05909 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms