Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms