Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apoc2Q05020 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms