Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk18Q04899 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms