Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelbQ04863 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms