Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk16Q04735 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk16Q04735 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk16Q04735 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk16Q04735 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk16Q04735 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk16Q04735 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms