Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnb1Q03717 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms