Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scg2Q03517 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms